O desenvolvimento da competência narrativa no âmbito da integração didática
Santos, Cláudia Sofia Almeida
2016
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É situação comum desconhecer-se o grau de parentesco entre a população na origem da
maioria dos programas de melhoramento genético de espécies florestais. Para resolver este
problema, desenvolvemos um protocolo de avaliação do parentesco utilizando 125
indivíduos e 16 microssatélites, da população base ou de referência (PR) de Eucalyptus
globulus do RAIZ. Através da recombinação gamética in silico foram simulados 105
indivíduos com diferentes graus de parentesco: descendentes de autopolinização, meiosirmãos,
irmãos completos e indivíduos não aparentados. Por simulação Monte-Carlo foram
calculados o valor médio e a variância associada à média dos diferentes grupos de
parentesco, com quatro coeficientes de similaridade genética. Compararam-se as funções
densidade dos diferentes grupos de parentesco, obtidas com quatro coeficientes de
parentesco, utilizando o valor crítico correspondente à intercepção das funções densidade
dos indivíduos não aparentados e dos meios-irmãos. O estimador escolhido foi aplicado à
PR. Detectaram-se 4,4% de pares de indivíduos potencialmente aparentados, com um erro
de tipo II de 8%. Inferimos também, o parentesco de um conjunto de 24 clones elite e
encontrámos 4 pares que são potencialmente aparentados. Futuros cruzamentos entre estes
indivíduos deverão ser evitados.
In this study we have analyzed the information
provided by 17 publicly available Eucalyptus
microsatellite (SSR) markers (Brondani et al.
1998, 2002; Jones et al. 2002; Steane et al.
2001) in the context of genetic identification
within a sample of 140 individuals from an elite
collection (denoted hereafter base) of RAIZ
genetic improvement population.
The base populations used in most forest tree
genetic improvement programs usually lack
detailed pedigree information. Molecular
markers, such as microsatellites (SSR), can be
used to estimate individuals’ pairwise
relatedness, which is based on the probabilities’
ratios of the identity in state between the
individuals compared and the reference
unrelated population These estimates can be
very useful to infer the level of relationship
among sub-populations of elite material and/or
for the design of controlled crosses between
putatively unrelated parents.
Using 113 putatively unrelated individuals -
genotyped with 18 SSR - self, full-sib, half-sib
and unrelated were simulated, and four pairwise
similarity coefficients were tested: Queller &
Goodnight 1989; Li et al. 1993; Ritland 1996,
and Lynch & Ritland 1999. The Lynch & Ritland
(1999) coefficient was selected (Figure 1), for it
displayed a better adjustment with the expected
level of relatedness and narrower standard
errors (SE). SE were calculated through Monte-
Carlo techniques, to avoid unequal sample size
bias, by using 105 simulations for each
relatedness group.
To illustrate the usefulness of molecular
estimates of similarity in genetic improvement
programs, a clustering (UPGMA) based on the
pairwise Lynch & Ritland (1999) coefficient (LR)
values was performed to infer about the putative
relationship among individuals of the subgroups
of E. globulus elite individuals. From that
analysis at least two pairs might be related and a
PCA analysis confirmed the clustering results.